Ο Αλέκος Φλαμπουράρης γεννήθηκε στην Αθήνα, τέλειωσε το 9ο Γυμνάσιο στην Πλατεία Κουμουνδούρου και αποτέλεσε ενεργό μέλος του μαθητικού κινήματος, συμμετέχοντας στους αγώνες για την αυτοδιάθεση της Κύπρου.

Κατά τη διάρκεια των σπουδών του στο Πολυτεχνείο του Γκρατς στην Αυστρία και κατόπιν στην Πολυτεχνική Σχολή Θεσσαλονίκης -από όπου απέκτησε και το δίπλωμα Πολιτικού Μηχανικού-, ως στέλεχος του ΚΚΕ και κατόπιν της Νεολαίας Λαμπράκη, έδωσε το «παρών» στους αγώνες πριν και κατά τη διάρκεια της δικτατορίας, όπου και συνελήφθη.
 Από τη Μεταπολίτευση μέχρι σήμερα συμμετέχει στην Πολιτική Γραμματεία του ΚΚΕ Εσωτερικού, του ΚΚΕ Εσωτερικού Ανανεωτική Αριστερά και του Συνασπισμού. Η σύζυγός του είναι γιατρός.

Τα τελευταία χρόνια είχε αποσυρθεί από την πολιτική σκηνή ωστόσο κατείχε τον ρόλο συμβούλου του κ. Τσίπρα.